Computer Vision Engineer (m/f/d) for Medical Image Analysis Full Time

Job description

Join Cancilico, an innovative startup at the intersection of medicine and artificial intelligence, on our mission to revolutionize cancer diagnostics. We are seeking two Computer Vision Engineers (m/f/d) to improve our products and help design and build new solutions.

We are building computer vision based software solutions to aid clinicians in cancer diagnostics. Help us expand our product portfolio in the areas of cell analysis, mutation prediction, cancer grading, treatment response prediction and companion diagnostics.

Profile:

• a university degree and proven expertise in domains like computer science, computer vision, machine learning, mathematical image processing, bioinformatics or comparable
• very good understanding of software development in the context of machine learning and computer vision (MLOps)
• practical knowledge of object-oriented programming with Python and the software development cycle in the AI environment (DevOps, MLOps, GitOps, testing), as well as container applications (Docker) and cloud technologies (Azure, AWS or Google Cloud)
• experience with agile software development methods
• you enjoy working in a team and are able to coordinate and implement topics independently and in a goal-orientated manner
• strong programming skills in modern deep learning frameworks (pytorch (preferred), tensorflow) and common scientific computing libraries (e.g. numpy, pandas, scikit, opencv)
• fluency in english
• conversational in german

Nice to haves:

• publications in leading journals/conferences in the fields of machine learning, image processing, medical image processing, medical informatics
• experience with project management, including scheduling and resource planning
• knowledge on clinical biostatistics eg. Kaplan Meier analysis

What You’ll Do:

• optimize existing pipelines for training and deployment of classsification, object-detection and segmentation models
• optimize models for generalizeability to differing imaging conditions (different microscopes/slide-scanners, variations in sample staining and exposure)
• keep up with SOTA developments in the CV field and apply them to improve existing products and prototype new products (especially regarding label efficient approaches like self-supervised learning, weakly-supervised learning, semi-supervised learning, finetuning of foundation models)
• build CV models to be used as digital biomarkers for mutations, diseases and treatment response in collaboration with pharma
• implementation of data-centred design principles to optimise data processing and analysis
• design of regression tests, data validation tests, unit tests and end-to-end tests, as well as application of design patterns
• design and development of modular, distributed, ML model-driven product lines and product matrices
• maintenance of repository systems for code, data and artefact management

We offer:

• a salary of 50-70k
• goal-orientated, unbureaucratic work in small, focused teams
• a challenging position in an innovative and fulfilling environment
• 30 days of paid leave
• wrapped up in a company culture that doesn’t loose sight of the individual

Our company culture:

At Cancilico, we foster an open and dynamic company culture where collaboration and teamwork thrive. We are working together on eye-level, with a shared passion and commitment to revolutionizing healthcare for everyone. We believe in the power of innovation and technology to make a meaningful impact on the lives of patients facing cancer.

We understand the importance of work-life balance and offer attractive home office arrangements designed for the modern era. Our family-friendly policies cater to individual needs, ensuring a harmonious integration of personal and professional life.

An office space should be designed to inspire your creativity and productivity. That’s why We prioritize your well-being by providing ergonomic furniture to support your physical comfort. Our coffee- and beverages-stocked kitchen reflects our dedication to creating a space where you can feel at ease and motivated to do your best work. We value your input, and our office environment is continually shaped to ensure it aligns with the needs and preferences of our team.

We encourage professional growth and offer opportunities for development to help you reach your full potential. As we work towards our collective goal of fighting cancer with cutting-edge AI technology, we celebrate each team member’s unique contributions and recognize the value of diverse perspectives.

Join us and be a part of an inspiring journey where you’ll not only grow professionally but also make a lasting difference in the lives of countless patients worldwide. Please send your application documents, indicating your earliest possible start date and salary expectations, with the subject line “Bewerbung CVE2024 [Your Name]” to job@cancilico.com.

Stellenbeschreibung

Kommen Sie zu Cancilico, einem innovativen Startup an der Schnittstelle von Medizin und künstlicher Intelligenz, auf unserer Mission, die Krebsdiagnostik zu revolutionieren. Wir suchen zwei Computer Vision Engineers (m/w/d), um unsere Produkte zu verbessern und bei der Gestaltung und Entwicklung neuer Lösungen zu unterstützen.

Wir entwickeln auf Computer Vision basierte Softwarelösungen, um Ärzte bei der Krebsdiagnostik zu unterstützen. Helfen Sie uns, unser Produktportfolio in den Bereichen Zellanalyse, Mutationsvorhersage, Krebsklassifizierung, Vorhersage der Behandlungsreaktion und Begleitdiagnostik (CDx) zu erweitern.

Profil:

• ein Hochschulabschluss und nachgewiesene Expertise in Bereichen wie Informatik, Computer Vision, maschinelles Lernen, mathematische Bildverarbeitung, Bioinformatik oder Vergleichbares.
• sehr gutes Verständnis der Softwareentwicklung im Kontext von maschinellem Lernen und Computer Vision (MLOps).
• praktische Kenntnisse in objektorientierter Programmierung mit Python und im Softwareentwicklungszyklus im KI-Umfeld (DevOps, MLOps, GitOps, Testing), sowie in Container-Anwendungen (Docker) und Cloud-Technologien (Azure, AWS oder Google Cloud).
• Erfahrung mit agilen Methoden der Softwareentwicklung.
• Sie arbeiten gerne im Team, können Themen koordinieren und eigenständig sowie zielorientiert umsetzen.
• starke Programmierkenntnisse in modernen Deep-Learning-Frameworks (PyTorch (bevorzugt), TensorFlow) und gängigen wissenschaftlichen Rechenbibliotheken (z.B. NumPy, Pandas, scikit, OpenCV).
• Sie beherrschen Englisch fließend in Wort und Schrift
• Sie sind konversationsfähig in Deutsch

Nice-to-haves:

• Veröffentlichungen in führenden Journals/Konferenzen in den Bereichen maschinelles Lernen, Bildverarbeitung, medizinische Bildverarbeitung, medizinische Informatik.
• Erfahrung im Projektmanagement, einschließlich Terminplanung und Ressourcenplanung.
• Kenntnisse in klinischer Biostatistik, z.B. Kaplan-Meier-Analyse

Ihre Aufgaben:

• Optimierung bestehender Pipelines für Training und Deployment von Klassifikations-, Objekterkennungs- und Segmentierungsmodellen
• Optimierung der Generalisierbarkeit von Modellen auf unterschiedlichen Bildbedingungen (verschiedene Mikroskope/Slide-Scanner, Variationen in der Probenfärbung und Belichtung)
• auf dem Laufenden bleiben mit den neuesten Entwicklungen im Bereich Computer Vision (insbesondere in Bezug auf label-effiziente Ansätze wie self-supervised learning, weakly-supervised learning, semi-supervised learning, finetuning von foundation models)
• deren Anwendung zur Verbesserung bestehender Produkte und zum Prototyping neuer Produkte
• Entwicklung von Computer Vision-Modellen zur Verwendung als digitale Biomarker für Mutationen, Krankheiten und Behandlungsreaktion in Zusammenarbeit mit der Pharmaindustrie
• Implementierung von datenzentrierten Designprinzipien zur Optimierung der Datenverarbeitung und -analyse
• Entwurf von Regressionstests und End-to-End-Tests sowie Anwendung von Designpatterns
• Entwurf und Entwicklung modularer, verteilter, KI-Modell-getriebener Produktlinien und Produktmatrizen
• Pflege von Repository-Systemen für Code, Daten und Artefaktmanagement

Wir bieten:

• ein Gehalt von 50-70.000 Euro
• zielorientierte, unbürokratische Arbeit in kleinen, fokussierten Teams
• eine anspruchsvolle Position in einer innovativen und erfüllenden Umgebung
• 30 Tage bezahlten Urlaub
• eingebettet in eine Unternehmenskultur, die den Einzelnen nicht aus den Augen verliert

Unsere Unternehmenskultur:

Bei Cancilico fördern wir eine offene, dynamische Unternehmenskultur, in der Zusammenarbeit und Teamarbeit gedeihen. Wir arbeiten auf Augenhöhe zusammen, mit der gemeinsamen Leidenschaft und dem Engagement, die Gesundheitsversorgung für alle zu revolutionieren. Wir glauben an die Kraft von Innovation und Technologie, um einen bedeutenden Einfluss auf das Leben von Krebspatienten zu haben. Wir verstehen die Bedeutung der Work-Life-Balance und bieten attraktive Home-Office-Arrangements, die auf die moderne Zeit zugeschnitten sind.

Unsere familienfreundliche Politik geht auf individuelle Bedürfnisse ein und sorgt für eine harmonische Integration von Privat- und Berufsleben. Ein Büroraum sollte so gestaltet sein, dass er Ihre Kreativität und Produktivität anregt. Wir legen Wert auf Ihr Wohlbefinden, indem wir ergonomische Möbel in charmanter Altbauumgebung bereitstellen, um Ihr körperliches Wohlbefinden zu unterstützen. Unsere mit Kaffee und Getränken ausgestattete Küche spiegelt unser Engagement wider, einen Raum zu schaffen, in dem Sie sich wohl fühlen und motiviert sind, Ihre beste Arbeit zu leisten.

Wir schätzen Ihren Input, fördern berufliches Wachstum und bieten Möglichkeiten für Weiterentwicklung, um Ihnen zu helfen, Ihr volles Potenzial zu entfalten. Während wir gemeinsam daran arbeiten, unser kollektives Ziel zu erreichen, Krebserkrankungen mit modernster KI-Technologie zu bekämpfen, schätzen wir die Beiträge jedes Teammitglieds und erkennen den Wert unterschiedlicher Perspektiven an.

Senden Sie bitte Ihre Bewerbungsunterlagen mit Angabe Ihres frühestmöglichen Starttermins unter dem Betreff “Bewerbung CVE2024 [Ihr Name]” an job@cancilico.com.